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WB樣本粘稠怎么辦?

2025-02-21 14:59:27

來(lái)源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺(tái)

    你是否會(huì)碰到這樣的問(wèn)題:在提取WB樣本的時(shí)候,加入裂解液后,離心發(fā)現(xiàn)管內(nèi)有非常多的膠狀物質(zhì),非常粘稠,即使多加裂解液也是無(wú)用,還會(huì)使得蛋白濃度降低。蛋白樣本若出現(xiàn)粘稠的情況,會(huì)對(duì)后續(xù)的檢測(cè)造成一定的影響,導(dǎo)致檢測(cè)結(jié)果不可靠,所以今天我們來(lái)研究一下導(dǎo)致的原因——普拉特澤生物承接WB等分子檢測(cè)相關(guān)服務(wù)上萬(wàn)例,積累了操作大量經(jīng)驗(yàn),為大家詳細(xì)分享WB樣本粘稠問(wèn)題,同時(shí)為廣大科研工作者開(kāi)展線上的理論培訓(xùn)線下實(shí)操,可承接wb實(shí)驗(yàn)外包服務(wù)。

【一】、蛋白樣本粘稠會(huì)造成什么情況?
1.樣品洗液困難:堵塞移液器:離心后,由于樣品粘稠,膠狀物會(huì)堵塞移液器頭,導(dǎo)致移液后上清液所剩無(wú)幾;無(wú)法分離上清液:樣品太過(guò)粘稠,移液時(shí)容易整體帶出,無(wú)法有效分離上清液。

2.無(wú)法測(cè)定及定量:樣品粘稠無(wú)法成為均一液體,導(dǎo)致蛋白定量(如使用BCA法)時(shí)OD值異常,無(wú)法進(jìn)行準(zhǔn)確的定量測(cè)定。

3.上樣困難:盡管加了loading buffer進(jìn)行煮樣,上樣樣品仍然特別粘稠,很難加入到膠孔中

電泳結(jié)果不佳:SDS-PAGE時(shí),粘稠的樣品會(huì)卡在點(diǎn)樣孔里,導(dǎo)致條帶不成直線,有嚴(yán)重拖尾,條帶不集中

4.蛋白丟失:粘稠物包裹蛋白導(dǎo)致無(wú)法釋放,樣品很難跑出理想的結(jié)果,有時(shí)甚至是完全沒(méi)有條帶。


【二】那么是什么造成蛋白質(zhì)樣本如此粘稠的呢?

1.核酸殘團(tuán):在細(xì)胞裂解過(guò)程中,細(xì)胞中的DNA纏繞其他大分子物質(zhì),形成粘稠的“核酸殘團(tuán)”。這些核酸殘團(tuán)與蛋白質(zhì)聚集在一起,使得樣本變得粘稠。核酸殘團(tuán)的存在會(huì)降低蛋白提取效率,使得蛋白質(zhì)丟失。

2.細(xì)胞碎片和油脂:裂解后的樣本中可能含有細(xì)胞碎片,如油脂、難溶蛋白等。這些成分也會(huì)增加樣本的粘稠度。
【三】如何有效降低蛋白樣本的粘稠?
1.使用柱式法提取蛋白:柱式法蛋白提取通過(guò)優(yōu)化的裂解液配方和離心管柱技術(shù),可以有效提高裂解效率,阻截核酸,減少樣本粘稠度。

2.超聲破碎:利用超聲波的能量破壞蛋白復(fù)合物,切割染色質(zhì),改善樣本粘稠狀態(tài)。但是超聲處理可能產(chǎn)生泡沫,影響蛋白濃度測(cè)定及后續(xù)實(shí)驗(yàn)。超聲產(chǎn)生的熱量可能導(dǎo)致蛋白質(zhì)變性或降解,因此應(yīng)避免用于磷酸化等敏感蛋白的研究。

3.使用核酸酶降解核酸:核酸酶可以降解樣本中的核酸,減少核酸殘團(tuán)的形成,從而降低樣本粘稠度。

4.延長(zhǎng)煮沸時(shí)間:在加入上樣緩沖液后,適當(dāng)延長(zhǎng)煮沸時(shí)間,可以使結(jié)合在基因組DNA上的蛋白充分釋放,同時(shí)導(dǎo)致基因組DNA的部分?jǐn)嗔眩档蜆颖菊吵矶取?/span>

5.反復(fù)抽吸:使用注射器反復(fù)抽吸樣本,可以打斷基因組DNA,改善樣本粘稠狀態(tài)。

 冰凍三尺,非一日之寒,普拉特澤致力于幫助廣大科研工作者解決WB實(shí)驗(yàn)過(guò)程中的各方面問(wèn)題,不但授人以魚(yú),亦授人以漁。