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Crispr/Cas9基因編輯介紹

2025-01-16 16:23:45

來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學整體課題外包平臺

    CRISPR/Cas9技術是區(qū)別于ZFN與TALENs的最新基因編輯技術,并在近年迅速得到推廣與應用。該技術擁有修飾效率高、操作簡便、成本廉價等多個優(yōu)點,因此在目前各項生物研究中成為最主流的基因編輯方式。
(一)技術起源與發(fā)展
CRISPR-Cas 系統(tǒng)最初是在細菌和古細菌的免疫系統(tǒng)中被發(fā)現(xiàn)的,它能夠幫助這些微生物識別和抵御外源遺傳物質的入侵,如噬菌體病毒和外源質粒等。

2012 年,科學家詹妮弗?杜德納(Jennifer Doudna)和艾曼紐?夏彭蒂耶(Emmanuelle Charpentier)首次證明了 CRISPR-Cas9 系統(tǒng)在體外可以對 DNA 進行特異性切割。

2013 年,張峰等人將 CRISPR-Cas9 技術成功應用于哺乳動物細胞的基因編輯,開啟了該技術在生物醫(yī)學領域廣泛應用的大門。

(二)系統(tǒng)組成與結構

Cas9 蛋白:是一種核酸內(nèi)切酶,具有切割雙鏈 DNA 的功能。它包含 RuvC1 和 HNH 樣核酸酶結構域,這兩個結構域分別負責切割 DNA 的兩條鏈,從而產(chǎn)生雙鏈斷裂。Cas9 蛋白行使功能需要依賴向導 RNA 的引導以及靶序列相鄰的原型間隔序列毗鄰基序(PAM)的識別。

向導 RNA(gRNA):由 CRISPR 轉錄產(chǎn)生的 crRNA 與反式激活的 tracrRNA 融合而成的單鏈引導 RNA(sgRNA)。sgRNA 的 5′端包含與靶 DNA 互補的 20nt 左右的序列,用于定位需編輯的位點;3′端則是與 Cas9 蛋白結合的區(qū)域,通過與 Cas9 蛋白相互作用,引導其到達目標基因的特定 DNA 序列上。
(三)作用機

識別與結合:sgRNA 首先與 Cas9 蛋白形成復合物,然后通過其 5′端的互補序列在基因組中尋找與之匹配的靶 DNA 序列。當找到匹配的靶序列后,sgRNA-Cas9 復合物會與靶 DNA 結合,同時識別靶序列下游的 PAM 序列,PAM 序列一般為 5′-NGG,它作為一種識別信號,確保 Cas9 蛋白能夠準確地結合到目標 DNA 上。

切割作用:在結合到靶 DNA 后,Cas9 蛋白的核酸酶結構域會被激活,分別在 PAM 序列上游第 3 個堿基處對 DNA 的兩條鏈進行切割,產(chǎn)生雙鏈斷裂。這種雙鏈斷裂是細胞內(nèi) DNA 修復機制啟動的信號,細胞會通過非同源末端連接或同源重組修復機制來修復斷裂的 DNA。

修復與編輯:非同源末端連接是一種易錯的修復方式,在修復過程中常常會引入插入或缺失突變,導致基因閱讀框發(fā)生改變,從而使基因功能喪失,實現(xiàn)基因敲除的效果。而如果在細胞中同時提供含有目的基因片段的供體 DNA 模板,細胞則會通過同源重組修復機制,以供體 DNA 為模板,將目的基因片段精準地插入到靶位點,實現(xiàn)基因敲入或替換等精確編輯。
(四)CRISPR/Cas9的優(yōu)勢

①高效性:能夠在多種細胞類型和物種中實現(xiàn)高效的基因編輯,大大提高了基因編輯的成功率和效率,為大規(guī)模的基因功能研究和基因治療等應用提供了有力支持。

②簡便性:與傳統(tǒng)的基因編輯技術相比,CRISPR-Cas9 系統(tǒng)的構建和操作相對簡單。只需要設計和合成針對目標基因的 sgRNA,并將其與 Cas9 蛋白表達載體共同導入細胞中,即可實現(xiàn)基因編輯,無需復雜的蛋白質工程和基因克隆等操作,降低了實驗難度和成本。

③特異性:通過合理設計 sgRNA,可以實現(xiàn)對基因組中特定目標基因的精確編輯,具有較高的靶向特異性。同時,隨著技術的不斷發(fā)展和優(yōu)化,對脫靶效應的控制也越來越有效,進一步提高了編輯的準確性和可靠性。

④多重編輯能力:可以同時設計多個針對不同靶位點的 sgRNA,實現(xiàn)對多個基因或同一基因的多個位點進行同時編輯,能夠更全面地研究基因之間的相互作用和復雜的生物學過程。

(五)CRISPR/Cas9的局限性

①脫靶效應:盡管經(jīng)過不斷優(yōu)化,CRISPR-Cas9 系統(tǒng)仍然存在一定程度的脫靶風險,即可能會在非目標位點產(chǎn)生切割和編輯,導致意想不到的基因突變,從而影響實驗結果的準確性和可靠性,甚至可能產(chǎn)生潛在的安全隱患。    

②編輯效率問題:在某些細胞類型或特定的基因組區(qū)域,CRISPR-Cas9 的編輯效率可能不夠理想,無法達到預期的編輯效果,需要進一步優(yōu)化實驗條件或采用其他輔助手段來提高編輯效率。           

③PAM 序列限制:Cas9 蛋白識別的 PAM 序列相對有限,這在一定程度上限制了可編輯的靶點范圍。對于一些缺乏合適 PAM 序列的基因區(qū)域,可能無法直接使用常規(guī)的 CRISPR-Cas9 系統(tǒng)進行編輯,需要開發(fā)具有不同 PAM 特異性的 Cas9 變體或其他基因編輯工具來解決。 

④倫理和法律問題:隨著 CRISPR-Cas9 技術在人類基因編輯等領域的應用逐漸深入,引發(fā)了一系列倫理和法律方面的爭議和擔憂,如生殖細胞基因編輯可能帶來的遺傳改變和倫理風險等,我們需要在技術發(fā)展的過程中建立健全相應的倫理準則和法律法規(guī)來規(guī)范其應用。